Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRXN3Q9Y4C0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms