Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms