Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms