Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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