Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP13Q9UII6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms