Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP25Q9UHP3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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