Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms