Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL9Q9P2J3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms