Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RDH8Q9NYR8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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