Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC6A13Q9NSD5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC6A13Q9NSD5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms