Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms