Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms