Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB18Q9NP72 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms