Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM3Q9NNZ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms