Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRHQ9HD43 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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