Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms