Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC4A5Q9BY07 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms