Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms