Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC106Q9BWC9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms