Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms