Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NPAS2Q99743 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms