Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP88Q99567 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP88Q99567 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms