Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM227BQ96M60 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM227BQ96M60 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms