Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms