Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms