Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms