Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUB2Q96DC9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms