Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF183Q96D59 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms