Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC1Q96C34 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC1Q96C34 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms