Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-CQ95604 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms