Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms