Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF4BQ92750 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms