Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC107Q8WV48 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms