Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms