Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms