Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APCDD1LQ8NCL9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms