Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLIP4Q8N3C7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLIP4Q8N3C7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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