Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMNTD2Q8IXW0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms