Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM5Q71RC9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM5Q71RC9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms