Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYDE1Q6ZW31 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms