Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC141Q6ZP82 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC141Q6ZP82 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms