Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM72Q6ZMU5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM72Q6ZMU5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms