Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms