Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CST9Q5W186 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms