Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USPL1Q5W0Q7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms