Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf135Q5VTT2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms