Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms