Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms