Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM259Q4ZIN3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM259Q4ZIN3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms