Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TWISTNBQ3B726 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TWISTNBQ3B726 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms